多介質過濾器中的濾料裝填順序為上層選擇密度小、顆粒大的無煙煤，其次為密度大、顆粒小的石英砂，底層為大顆粒承托層。出現亂層的原因有：一是反洗強度過大，造成反洗水量過大，從而形成亂層；二是多介質過濾器的下布水系統分布不均勻，局部的反洗水量大，某些部位反洗水量小，造成的亂層。建議反洗時觀察濾料的膨脹高度，如果膨脹高了，就可能是反洗水量過大；如果膨脹高度不大，則很有可能是布水不均勻或進水流量小造成的。
濾料亂層之后，過濾效果變差，出水污染指數不合格，縮短后續保安過濾器的濾芯運行周期，增加運行成本，同時加速了反滲透的污染。出現濾料亂層現象的解決辦法有：
1、把濾料從過濾器中全部掏出，用與濾料相同目數的篩網進行重新篩分，此方法費時費力，不能完全達到重新分離的效果，一般不采用。
2、重新更換新濾料，為了避免過濾器濾料再次亂層，反洗過程中必須嚴格按照操作規程操作，控制好反洗水量，反洗水量為正常運行出水量的2.5~4倍（16~24L/m2?s），另外，反洗進水閥應緩慢開啟，避免瞬時大流量反洗；若是多介質過濾器的下集水系統采用穹形板式裝置，則應更改為布水更均勻的隔板水帽式裝置（水帽最好采用雙速濾帽），防止局部反洗水量大造成的亂層。
3、可以考慮選擇均質濾料，以保證良好的過濾效果，且不會出現反洗亂層現象。
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